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中华细胞与干细胞杂志(电子版)

中华细胞与干细胞杂志(电子版) ›› 2017, Vol. 07 ›› Issue (01) : 49 -53. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-1221.2017.01.009

所属专题： 文献；

论著

不同时间下超低温保存肝癌组织细胞RNA完整性的差异分析
曹国强1, 张峰1, 陈雷鸣1, 陈海1, 李彪1, 冯晓文1, 李红春2, 谢海洋1, 周琳,1   
  1. 1. 310003　杭州，浙江大学医学院附属第一医院卫生部多器官联合移植研究重点实验室　浙江省器官移植重点实验室
    2. 518112　深圳市第三人民医院肝胆外科
  • 收稿日期:2016-07-19 出版日期:2017-02-01
  • 通信作者: 周琳
  • 基金资助:
    浙江省"十二"五基层卫生适宜技术成果转化工程重大项目(2013T301-15); 深圳市三名工程科技计划项目(ZDSYS201504301534057)

Analysis of RNA integrity of hepatocellular carcinoma cells with different cryopreservation times

Guoqiang Cao1, Feng Zhang1, Leiming Chen1, Hai Chen1, Biao Li1, Xiaowen Feng1, Hongchun Li2, Haiyang Xie1, Lin Zhou,1   

  1. 1. First Affiliated Hospital, Key Laboratory of Combined Multi-organ Transplantation, Ministry of Public Health, Key Laboratory of Organ Transplantation, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310003, China
    2. Shenzhen Third People’s Hospital, Division of Hepatobiliary Surgery, Shenzhen 518112, China
  • Received:2016-07-19 Published:2017-02-01
  • Corresponding author: Lin Zhou
  • About author:
    Corresponding author:Zhou Lin, Email:
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引用本文：

曹国强, 张峰, 陈雷鸣, 陈海, 李彪, 冯晓文, 李红春, 谢海洋, 周琳. 不同时间下超低温保存肝癌组织细胞RNA完整性的差异分析[J/OL]. 中华细胞与干细胞杂志(电子版), 2017, 07(01): 49-53.

Guoqiang Cao, Feng Zhang, Leiming Chen, Hai Chen, Biao Li, Xiaowen Feng, Hongchun Li, Haiyang Xie, Lin Zhou. Analysis of RNA integrity of hepatocellular carcinoma cells with different cryopreservation times[J/OL]. Chinese Journal of Cell and Stem Cell(Electronic Edition), 2017, 07(01): 49-53.

目的

研究肝癌组织细胞样本于-80℃超低温保存条件下的质量控制，探讨肝癌组织细胞样本在超低温保存中的时效性。

方法

随机抽取超低温新鲜冻存（24 h内）、保存3个月、6个月和1年不同时长的肝癌和对应的癌旁组织细胞各12对，HE染色评估标本取材的准确性，采用Promega自动提取核酸仪提取肝脏细胞RNA，利用Agilent 2100生物分析仪进行RIN值及28S/18S比值分析。对新鲜冻存、保存3个月、6个月以及1年的组织细胞样本的RIN值和28S/18S比值进行组间非配对t检验。

结果

HE染色镜下观察发现切片组织细胞中肿瘤细胞比例达到80﹪以上，为生物样本库的合格样本。生物分析仪检测结果显示超低温新鲜冻存、保存3个月、6个月和1年的癌和癌旁组织细胞的RIN均值均>7.0，平均28S/18S比值均>1.5，组间非配对t检验显示，保存1年的肝癌组织细胞相比于新鲜冻存（7.442±0.674vs8.617±0.769，P = 0.001）、保存3个月（7.442±0.674vs8.275±0.617，P = 0.005）和6个月（7.442±0.674vs8.175±0.970，P = 0.043）的组织细胞RIN值显著下降，提示存在一定程度的RNA降解，而其余各组之间差异均无统计学意义（P均> 0.05）。

结论

在超低温条件下新鲜冻存、保存3个月、6个月的肝癌及癌旁组织细胞，其质量均可以获得有效保证，而保存1年的肝癌组织细胞的RNA虽然存在一定程度的降解，但能够满足后续临床科研的要求。

关键词: 肝肿瘤, 组织细胞, RNA, 低温保存
Objective

To evaluate the quality control system for cryopreservation of hepatocellular carcinoma cells under-80℃as time relapses.

Methods

Hepatocellular carcinoma tissue was frozen within 24 hours after harvesting and stored for three months, six months and one year under ultra-low temperature respectively (n = 12 for each group) . Hepatocellular carcinoma and paracancerous tissue were identified by HE Staining. Promega automatic nucleic acid extraction instrument was used to extract RNA from HCC cells. RIN (RNA integrity number) value and 28S/18S ratio was evaluated by Agilent 2100 Bioanalyzer.

Results

The percentage of tumor cells were found in more than 80﹪of the samples by HE staining, and were considered as qualified samples. The average RIN values and 28S/18S ratios for HCC tissue stored for three months, six months and one year were > 7.0 and > 1.5 respectively. Unpairedttest showed that RIN value of cells stored for one year was decreased significantly compared with that freshly collected samples (7.442±0.674vs8.617±0.769,P= 0.001) or samples stored for three months (7.442±0.674vs 8.275±0.617,P= 0.005) and six months (7.442±0.674vs8.175±0.970,P = 0.043) , suggestingthe presence of RNA degradation. There was no significant difference between the other groups (P> 0.5) .

Conclusion

Morphology for tumor cells, RIN value and 28S/18S ratio can be used as indicators for monitoring the quality of liver cancer samples. Sample quality remained good when stored at ultra-low temperatures for three months or six months, although there was a certain degree of RNA degradation for samples that stored for one year.

Key words: Liver neoplasms, Histiocytes, RNA, Cryopreservation
图1 光学显微镜下观察肝癌组织及癌旁组织细胞形态（HE染色，×200）
图2 Agilent 2100生物分析仪模拟电泳图
图3 RNA分析
表1 12对不同保存时间点肝癌与癌旁组织细胞样本的RIN值比较（ ± s）
分组 0个月 3个月 6个月 12个月 F值 P值
癌 8.617±0.769a 8.275±0.617a 8.175±0.970a 7.442±0.674 4.964 0.005
癌旁 7.742±0.464 7.825±0.956 7.533±0.768 7.550±0.815 0.416 0.742
表2 12对不同保存时间点肝癌与癌旁组织细胞样本的28S/18S比值比较（ ± s）
分组 0个月 3个月 6个月 12个月 F值 P值
癌 1.625±0.398 1.558±0.219 1.608±0.309 1.508±0.223 0.379 0.769
癌旁 1.525±0.314 1.517±0.335 1.575±0.540 1.542±0.312 0.053 0.984
1
郜恒骏，朱明华.重视肿瘤组织库的标准化建设和应用[J].中华病理学杂志, 2008, 37(12):797-798.
2
阮亮亮，郑培永，杨佳泓,等.生物样本库RNA质量控制的方法学验证[J].转化医学杂志, 2015, 4(3):161-165.
3
中华人民共和国卫生部.原发性肝癌诊疗规范(2011年版)[J].临床肝胆病杂志, 2011, 27(11):1141-1159.
4
Wang YG, Zheng H, Chen J, et al. The impact of different preservation conditions and Freezing-Thawing cycles on quality of RNA, DNA, and proteins in cancer tissue[J].Biopreserv Biobank, 2015, 13(5):335-347.
5
张园，朱琳，郭文佳,等.新疆肿瘤资源库样本质量控制体系建立[J].新疆医科大学学报, 2014, 37(12):1657-1660.
6
白纪刚，吕毅，王浩华,等.实验用猪胰腺和小肠组织总RNA提取及鉴定[J].陕西医学杂志, 2005, 34(10):1182-1184.
7
许传亮，徐振宇，孙颖浩,等.肾癌组织与癌旁组织RNA降解差异的研究[J].中华实验外科杂志, 2003, 20(9):819-820.
8
Kap M,Oomen M,Arshad S, et al. Fit for purpose frozen tissue collections by RNA integrity number-based quality control assurance at the Erasmus MC tissue bank[J].Biopreserv Biobank, 2014, 12(2):81-90.
9
蒋超，曹日昇，陈俊娣,等.生物样本库样本质量控制体系建立的初步探索[J].江苏医药, 2016, 42(2):198-200,封3.
[1] 刘伟, 牛云峰, 安杰. LINC01232 通过miR-516a-5p/BCL9 轴促进三阴性乳腺癌的恶性进展[J/OL]. 中华乳腺病杂志(电子版), 2024, 18(06): 330-338.
[2] 周荷妹, 金杰, 叶建东, 夏之一, 王进进, 丁宁. 罕见成人肋骨郎格汉斯细胞组织细胞增生症被误诊为乳腺癌术后骨转移一例[J/OL]. 中华乳腺病杂志(电子版), 2024, 18(06): 380-383.
[3] 安杰, 牛云峰, 刘伟. LINC00520 通过miR-519b-3p/HIF1A 轴促进胃癌的侵袭转移[J/OL]. 中华普通外科学文献(电子版), 2024, 18(06): 430-436.
[4] 高俊颖, 张海洲, 区泓乐, 孙强. FOLFOX-HAIC 为基础的肝细胞癌辅助转化治疗的应用进展[J/OL]. 中华普通外科学文献(电子版), 2024, 18(06): 457-463.
[5] 马中正, 杨云川, 马翔, 周迟, 丁丁, 霍俊一, 徐楠, 崔培元, 周磊. 胰腺癌双硫死亡相关的lncRNA预后模型的构建及免疫反应研究[J/OL]. 中华普通外科学文献(电子版), 2024, 18(05): 368-376.
[6] 常小伟, 蔡瑜, 赵志勇, 张伟. 高强度聚焦超声消融术联合肝动脉化疗栓塞术治疗原发性肝细胞癌的效果及安全性分析[J/OL]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2025, 19(01): 56-59.
[7] 赖全友, 高远, 汪建林, 屈士斌, 魏丹, 彭伟. 三维重建技术结合腹腔镜精准肝切除术对肝癌患者术后CD4+、CD8+及免疫球蛋白水平的影响[J/OL]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(06): 651-654.
[8] 李一帆, 朱帝文, 任伟新, 鲍应军, 顾俊鹏, 张海潇, 曹耿飞, 阿斯哈尔·哈斯木, 纪卫政. 血GP73水平在原发性肝癌TACE疗效评价中的作用[J/OL]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(06): 825-830.
[9] 陆镜明, 韩大为, 任耀星, 黄天笑, 向俊西, 张谞丰, 吕毅, 王傅民. 基于术前影像组学的肝内胆管细胞癌淋巴结转移预测的系统性分析[J/OL]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(06): 852-858.
[10] 吴雪云, 胡小军, 范应方. 肝切除术中剩余肝再生能力的评估与预测[J/OL]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(06): 894-897.
[11] 林小勇, 张兰霞, 曾庆劲, 贺需旗, 谭雷, 郭光辉, 龙颖琳, 李凯, 吴宇轩. 负压抽吸活检针在肝困难病灶活检中的初步应用研究[J/OL]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(05): 694-698.
[12] 雷永琪, 刘新阳, 杨黎渝, 铁学宏, 俞星新, 耿志达, 刘雨, 陈政良, 惠鹏, 梁英健. 肝脏血管周上皮样细胞肿瘤合并贫血一例并文献复习[J/OL]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(05): 710-718.
[13] 董晓斌, 张静, 苏莎莎, 莎比亚·沙吾提, 盛好. 溃疡性结肠炎患者相关环状RNA 差异表达谱分析及功能研究[J/OL]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2024, 13(06): 499-509.
[14] 张蔚林, 王哲学, 白峻阁, 黄忠诚, 肖志刚. 利用TCGA数据库构建基于miRNA的结直肠癌列线图预后模型[J/OL]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2024, 13(05): 381-388.
[15] 王国强, 张纲, 唐建坡, 张玉国, 杨永江. LINC00839 调节miR-17-5p/WEE1 轴对结直肠癌细胞增殖、凋亡和迁移的影响[J/OL]. 中华消化病与影像杂志(电子版), 2024, 14(06): 491-499.
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